近日,威尼斯官网刘丹副教授研究团队在单分子RNA可视化检测方面取得新进展,相关成果以“Chromogenic Visualization of Single RNA Molecules In Situ with Duplex Capability by Rolling Circle Amplification with Alkaline Phosphatase”为题发表于国际权威期刊《Analytical Chemistry》(DOI:10.1021/acs.analchem.3c02443)。
该研究工作针对现有荧光RNA原位检测技术易受光漂白,组织自发荧光干扰导致信噪比低的技术难点,发展了基于酶信号放大的单分子RNA原位检测新方法,在明场条件下实现单个RNA分子的可视化及双重靶标的同时分析。具体而言,该方法采用锁式探针和滚环扩增技术实现mRNA的高选择性识别和信号放大,并联合碱性磷酸酶(ALP)和辣根过氧化物酶(HRP)催化显色反应,即基于ALP的FAST RED和基于HRP的DAB显色同时产生可检测的红色和棕色信号点,在明场条件下实现HPV及MKI67 mRNA的单分子水平共检测。该方法具有简单、易操作等优点,在宫颈癌前病变(CIN)的临床准确诊断与分级等方面具有重要应用前景。
威尼斯9499登录入口生物与医药专业2020级研究生黄若兰为该研究工作的第一作者,导师刘丹副教授为通讯作者,复旦大学附属中山医院厦门医院病理科刘坤为共同第一作者,厦门大学杨朝勇教授、威尼斯9499登录入口柯荣秦教授及上海交通大学瑞金医院董磊教授为共同通讯作者。该项工作得到了国家重点实验室开放基金、福建省自然科学基金、威尼斯9499登录入口中青年教师科技创新计划等项目的资助。
论文链接:https://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/acs.anal chem.3c02443